У пошуках Сплінтера Черепашки Ніндзя знаходять лігво інопланетян і випадково вмикають телепорт, який переносить їх до іншої галактики. Вони опиняються в центрі боротьби між Федерацією та Імперією трицератонів. Дві раси намагаються захопити професора Ханікатта, чия свідомість опинилася в тілі робота. Ханікатт винайшов телепорт, володіння яким дасть велику військову перевагу. Трицератони захоплюють робота і їхній імператор прагне дізнатися секрет телепортації шантажем. Черепашки постають перед важким вибором, але останньої миті їх повертають на Землю утроми — дружні інопланетяни, що врятували Сплінтера. Як з'ясовується, в давнину зореліт утромів розбився в Японії, перевозячи злочинця. Той утік і сконструював собі механічне тіло, ставши Шреддером. Стокман, який існує тепер як голова на роботизованій платформі, саботує пристрої утромів, дозволяючи Шреддеру вдертися до сховку прибульців. Черепашки перемагають Шреддера і той, як здавалося, гине від вибуху.
